同居数十年后分居的双胞胎肠道微生物菌株持续存在

导读 您的指纹终生保持不变。但是,双胞胎肠道中共有的微生物菌株指纹又如何呢?研究人员使用位于伯明翰的阿拉巴马大学开发的基因组学菌株追踪生

您的指纹终生保持不变。但是,双胞胎肠道中共有的微生物菌株“指纹”又如何呢?

研究人员使用位于伯明翰的阿拉巴马大学开发的基因组学菌株追踪生物信息学工具,研究了在共同生活了几十年的成年双胞胎开始分居后,这些共有的细菌菌株是否保持稳定并对饮食或环境的变化具有弹性。

发表在PLOS One杂志上的 UAB 研究分析了来自双胞胎对的两个宏基因组测序数据库——一个针对仍然生活在一起的孩子,另一个来自成年双胞胎,年龄在 36 到 80 岁之间,他们分开生活了 1 到 1 个月。 59岁。

“年龄在 36 到 80 岁之间的成年双胞胎表明,一对双胞胎之间的某种菌株或菌株在分离后是共享的,”UAB 细胞、发育和综合系名誉教授 Casey Morrow 博士说。生物学。“虽然我们不知道双胞胎中这些共有微生物的来源,但这些结果表明非同居双胞胎之间可能存在数十年共享菌株的可能性。作为这些研究的必然结果,我们的研究建立了微生物菌株稳定性的时间线在人体肠道中。”

该研究使用了 UAB 先前开发的应变跟踪生物信息学工具,称为基于窗口的相似性单核苷酸变体或 WSS。UAB 遗传学和基因组学核心系 Hyunmin Koo 博士领导了信息学分析。该研究生成了大约 6 TB 的数据,这些数据在 Cheaha UABgrid 超级计算机和 UAB 信息技术研究计算小组的帮助下进行了分析。

Morrow 和他的同事在之前的几项菌株追踪研究中使用了这种微生物指纹工具。2017 年,他们发现用于治疗复发性艰难梭菌感染患者的粪便供体微生物在粪便移植后会在受体体内保留数月或数年。2018 年,他们表明肥胖手术引起的上消化道变化导致了新微生物菌株的出现,2019 年,他们分析了抗生素治疗后新菌株在个体体内的稳定性。

目前的研究使用了来自八名双胞胎儿童和 50 名双胞胎成人的粪便样本的宏基因组测序数据库。

UAB 的研究人员发现,与分开生活一段时间后的成年双胞胎相比,仍然住在一起的儿童年龄双胞胎有更多的共享菌株对。在成年双胞胎中,那些分居时间不到 10 年的双胞胎比分居时间较长(10 到 60 年)的双胞胎共享更多的相关菌株对。

具体来说,在一起生活了 79 年然后分开 1 年的 80 岁双胞胎显示出最多的相关菌株对。下一个最高数量的相关菌株对是在一起生活了 51 年然后分开五年的 56 岁双胞胎中发现的,在一起生活了 66 年然后分开七年的 73 岁双胞胎中,而在 36 岁的双胞胎中,他们分开了 19 年。